由于日本、欧盟食品安全新法规于2006年正式实施，大幅抬高了进口农产品的门槛，对我国具有比较优势的农产品出口造成较大影响。

农产品园艺产品出口到日本主要流程：

一、进口检验检疫申请。

进口商输入植物或植物产品，都必须要出示出口国家的植物检疫证明书。必须在货品抵达口岸后，随即向植物防疫所提出检疫书面申请书，不得延误。申请进口检查，申请者必须缴交输出植物检疫证明书（IPPC的标准格式），或由政府植物检疫机构核发的证明文件。

二、进口检查

检查地点由植物检疫官指定，在货物抵达的港口或机场执行。如果植物进口是用邮寄方式，检查地点是在海关的邮局。一般而言，检查是用肉眼目视，必要时也会将样本切断、剥皮或筛别，并借助显微镜进行检查。一般，在完成农产品进口检查后，即可发给检查证明书。

三、消毒、废弃

如果在我国出口农产品园艺产品，那么建议在出口前进行必要的包装、运输和贮藏产品处理时，避免附着昆虫。因为在日本进口农产品进口检查时，如果发现病虫害，要求消毒，直至无病虫害。这样，会影响进口通关效率。

日本对于出口到本国的农产品园艺产品进口检验检疫检查极其严格，而且还积极保护本国农业权益，出台了《种苗修改法》。另一方面也加大了对于输出到日本的农产品园艺产品的处罚力度。

农产品园艺产品进出口贸易代理受各国贸易壁垒影响，但并不影响农产品出口的快速增长。我国也在加大对于农产品园艺产品进出口的贸易补贴，并且积极建立完善的农产品出口政策支持体系，为我国农产品园艺产品进出口贸易保驾护航。